المسجد بعد الانتهاء من عمارته، وفيما يلي النص المكتوب على اللوحة المثبتة في الجهة الغربية من المسجد.
قال الله تعالى: {لمسجد أسس على التقوى من أول يوم أحق أن تقوم فيه}. بسم الله الرحمن الرحيم: تحت رعاية خادم الحرمين الشريفين الملك فهد بن عبد العزيز آل سعود وفي عهد الميمون تم بعون الله وتوفيقه الاحتفال بإنجاز مشروع إِعادة بناء وتوسعة مسجد قباء بالمدينة المنورة، وذلك في يوم 26/ 2 / 1406هـ الموافق 29/ 10 / 1986م.
وصف المبنى: يشتمل التكوين الأساسي للمسجد على بناء
مستطيل مع إِيجاد فناء داخلي تفتح عليه جميع المداخل، وقد خصص الجزء الشمالي منع كمصلى للنساء وهو مكوّن من دورين بمداخل منفصلة عن الرجال.
وللمسجد 56 قبة صغيرة بقطر 6م و6 قباب كبيرة بقطر 12م وثمة 8 قباب مترابطة على مداخل المسجد، وهناك أربع مآذن في الأركان الأربعة للمسجد متطابقة الشكل وارتفاع كل واحد منها 47م من سطح الأرض، وتم تجليد حوائط المسجد بارتفاع 6ر3م بالجرانيت، وأرضيات الصحن المكشوف غطيت بالرخام والجرانيت المزخرف، وتم تصميم الأبواب من خشب التيك، وغطي الصحن المكشوف بخيمة كهربائية متحركة لأحدث النظريات الهندسية لوقاية المصلين من حرارة الشمس، وتم تكييف المسجد بأجهزة تكييف مركزية.
وقد تم بناء ملحق في الجهة الشرقية من خمس منازل للأئمة والمؤذنين وعدد من المكاتب الإِدارية والمكتبة ومعارض للتسويق وهكذا أصبحت المساحة الإِجمالية نحو 500ر13م2، ويستوعب المسجد عشرين ألف مصل بما فيه الساحات الخارجية المرصوفة ومساحتها (2474م2).